An ontology based approach in health information systems: Blood test ontology example

Health domain is a complex and distributed research area, where different institutions and people take and provide service, at the same time. Therefore, the health data about a patient is completely distributed among doctors, clinics, hospitals, pharmacies and insurance companies. To share and reuse the distributed, well-structured and semantically rich clinical data with the appropriate permissions from anywhere is one of the major areas that the research of information systems focused in healthcare domain in recent years. The semantic web provides a technological infrastructure with representing the meaning of data and reasoning new information from the existing knowledge for the healthcare domain. The blood, as the life fluid, gives hints to the clinicians about a patient's general health status by analyzing the ingredients in. The results of blood tests contain lots of information that can be used by different clinics. In the diagnostic phase, analyzing the blood for the same tests repeatedly delays to start the treatment process and increases the cost. The Blood Test Ontology is developed to model the blood tests semantically that is done in the health field and also to define information related with the blood and the blood tests as well as the relationships between them. The ontology in this work is developed with the aim to be used in the health information system, which should provide the querying, sharing and reusing the personalized the blood test result of the patients, as a knowledge base. The Blood Test Ontology is supported by the medical information standards to be able to interoperable with the other medical ontologies that are developed in the health.

Saðlýk bilgi sistemlerinde ontoloji tabanlý bir yaklaþým: Kan testi ontolojisi örneði

Saðlýk alaný, farklý kurum ve kiþilerin hizmet aldýðý ayný zamanda da hizmet sunduðu daðýtýk ve karmaþýk bir alandýr. Bir hasta ile ilgili saðlýk veriler de bunun sonucunda; doktorlar, klinikler, eczaneler, sigorta þirketleri ve hastaneler arasýnda tamamen daðýlmýþ durumdadýr. Anlamsal olarak zengin ve yüksek seviyede yapýlandýrýlmýþ bu daðýtýk klinik verinin saðlýk alanýnda her yerden uygun izinler ile paylaþýlmasý ve yeniden kullanýlabilmesi, son yýllarda bilgi sistemlerinin odaklandýðý önemli çalýþma alanlarýndan biridir. Anlamsal Web'in sunduðu verinin anlamýný sunarak bilginin gösterilebilmesi ve bilgilerden yeni bilgiler çýkarýlmasý, saðlýk alaný için uygulanabilecek teknolojik bir alt yapý sunmaktadýr. Yaþam sývýsý olan kan, içeriðindeki maddeler ile kiþilerin hastalýklarý hakkýnda doktorlara ipuçlarý vermektedir. Saðlýk alanýnda kan testlerinin sonuçlarý birçok farklý klinik tarafýndan kullanýlabilecek bilgiyi içermektedir. Hastalýðýn teþhis aþamasýnda, ayný kan testlerinin yeniden yapýlmasý teþhis süresini uzatýp tedaviyi geciktirirken, maliyeti arttýran bir süreçtir. Kan Testi Ontolojisi, kan ile ilgili saðlýk alanýnda yapýlan tüm týbbý testleri anlamsal olarak modellemek, kan ve kan testlerine iliþkin bilgileri ve bunlar arasýndaki iliþkileri tanýmlamak üzere geliþtirilmiþtir. Hastalarýn kiþiselleþtirilmiþ kan test sonuçlarýnýn sorgulanmasýný, paylaþýlmasýný ve yeniden kullanýlmasýný saðlayacak olan bir saðlýk bilgi sisteminin bilgi tabaný olarak kullanýlmasý amacýyla geliþtirilen Kan Testi Ontolojisi, saðlýk alanýnda farklý týbbi ontolojiler ile birlikte çalýþabilir olabilmesi için týbbi biliþim standartlarý ile de desteklenmektedir.