Pamukkale Univ Muh Bilim Derg. 2018; 24(2): 260-265 | DOI: 10.5505/pajes.2017.23169

Örüntü tanýma teknikleri ile agar yüzeyi üzerinde koloni morfoloji sýnýflandýrmasý

Volkan Altuntaþ¹, Seda Altuntaþ², Murat Gök^3
1Bursa Teknik Üniversitesi, Bilgi Ýþlem Departmaný, Bursa
²Bursa Teknik Üniversitesi Mühendislik Fakültesi, Gýda Mühendisliði Ana Bilim Dalý, Bursa
³Yalova Üniversitesi, Bilgisayar Mühendisliði Bölümü, Yalova

Mikroorganizmalar çýplak gözle göremeyeceðimiz kadar küçük canlýlardýr. Ekolojik dengede rol oynayan mikroorganizmalar temel olarak bakteriler, mantarlar, algler, virüsler ve protozoalardan oluþur. Besiyeri ve petri kabý, mikroorganizmalarýn ortamdan yalýtýlmasý, geliþtirilmesi, tanýmlanmasý, sayýmý gibi iþlemlerin yerine getirilmesi için agar ve diðer besin maddeleri karýþtýrýlarak, mikroorganizmalara büyüme ortamý saðlamak amacý ile kullanýlýrlar. Mikroorganizmalar çoðalarak sayýsý milyonlara hatta daha fazlasýna ulaþabilir böylece çýplak gözle görülebilen, koloni olarak adlandýrýlan yapýlarý oluþtururlar. Terminolojide bu yapý, koloni oluþturan birim (kob, cfu) olarak ifade edilir. Peynir, ekmek, meyve veya yoðurtlarýn üzerindeki küfler, çikolata, marmelat gibi þeker içeren gýdalar üzerindeki mayalar, mikroorganizmalarýn çoðalarak oluþturduðu kolonilerdir. Besiyeri üzerinde oluþan koloniler, mikroorganizma ve üreme ortamýna baðlý olarak farklý morfolojik özelliklerde görüntüler oluþturmaktadýr. Bu çalýþmada koloni görüntülerinden görüntü iþleme ve örüntü tanýma teknikleri ile mikroorganizmalarýn sýnýflandýrýlmasý yapýlmaktadýr.

Anahtar Kelimeler: Mikrobiyoloji, Koloni oluþturan birim, Taksonomi, Segmentasyon, Öznitelik çýkarýmý, Sýnýflandýrma

---

Pattern recognition techniques on agar surface colony morphology classification

Volkan Altuntaþ¹, Seda Altuntaþ², Murat Gök^3
1Bursa Technical University, Department of Information Technologies, Bursa
²Department of Food Engineering, Bursa Technical Universtiy, Bursa, Turkey
³Yalova University, Department of Computer Engineering, Yalova

Microorganisms are small organisms as we cannot see with the naked eye. Microorganisms that play a role in the ecological balance are mainly composed of bacteria, fungi, algae, viruses and protozoa. The medium and petri dish are used in order to provide the growth medium to microorganism by mixing agar and other nutrients for performing operations such as isolating from the environment, growth, counting of microorganisms. The number of microorganisms may reach the million or even more by reproductively, in this way they form structures called colony which can be seen with the naked eye. In terminology, this structure expressed as colony forming units (cfu). Mold on the cheese, bread, fruit or yogurt, yeast on the sugar-containing foods such as chocolate, marmalade are colonies formed by grown microorganism. Colonies formed on the agar, create images of different morphological characteristics depending on the microorganism and growth media. In this paper, classification of microorganism is performed from the colony images by image processing and pattern recognition techniques.

Keywords: Microbiology, Colony forming unit, Taxonomy, Segmentation, Feature extraction, Classification

---